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製品の特長 - NGS解析ソフトウェア「Amelieff Quick Start Package」
特長
検証済みの解析プロトコルを用いて、データ解析を自動で実行
Linux,Rを用いた実行から記録まで、解析環境を１つに集約
データ解析の柔軟な拡張性と再現性の確保
概要 - NGS解析ソフトウェア「Amelieff Quick Start Package」
オープンソースソフトウェアやRの実行、解析プロトコルと解析結果の記録まで、１つの環境でデータ解析が完結。 Amelieff Quick Start Packageは、データ解析の効率化に貢献します。
■解析プロトコル
【シングルセルRNAseq解析】
次元削減とクラスタリング、高発現遺伝子の同定、Feature plot 作図、Gene Ontology解析、パスウェイ解析、全クラスターにおける二群間発現比較、擬似系譜解析
【RNAseq解析】
発現定量、主成分分析、階層的クラスタリング、発現変動遺伝子の検出、二群間比較解析、Gene Ontology解析、パスウェイエンリッチメント解析
【WES遺伝性変異解析】
fastqファイルからアノテーションまで自動で解析、アノテーション後はレポートファイルを出力
【WESがん変異解析】
正常、腫瘍細胞データから体細胞変異検出、MAFサマリー作図、Oncoplot、ホットスポット可視化、Mutation Signature解析
【ATAC-seq解析】
ピーク検出、ピークアノテーションCoverage plot、TSS Average profile plot、パスウェイ解析、結合モチーフ探索
【細菌叢解析】
Qiime2によるメタゲノム解析、クオリティコントロール、系統樹作成、多様性解析(α多様性䛾検定、β多様性䛾検定)、taxon解析
仕様 - NGS解析ソフトウェア「Amelieff Quick Start Package」
| 型式 | 該当項目: なし |
|---|---|
| サイズ | 該当項目: なし |
| 質量 | 該当項目: なし |
| 電源 | 該当項目: なし |
| その他 | 最新 永続版PC用ライセンス: PC１台に解析プロトコル１本を導入致します。ローカルマシンとしてご利用いただくライセンスです。※リモート接続非対応 最新 永続版サーバ用ライセンス: サーバへセットアップ致します。複数人でリモート接続しご利用いただくライセンスです。 解析システムエントリーモデル: 解析プロトコル１本をノートPCへインストールしてご提供致します。 |
| メーカー希望小売価格(税別) | 250,000円〜 |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
- 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
- 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。